Mapa de RNA edQTL en tejidos humanos. Crédito: Naturaleza (2022). DOI: 10.1038/s41586-022-05052-x
Un equipo de investigadores de la Universidad de Stanford, en colaboración con dos colegas de la Universidad de Fudan y otro del Instituto Broad del MIT y Harvard, encontró evidencia que sugiere que las variantes genéticas que frenan la edición del ARN A-a-I pueden estar asociadas con un mayor riesgo de trastornos autoinmunes. En su artículo publicado en la revista Naturaleza, el grupo describe cómo analizaron los datos de expresión genética de muestras de tejido recolectadas de cientos de donantes humanos para identificar variantes genéticas que afectan la edición del ARN y lo que aprendieron al hacerlo. Kaur Alasoo, de la Universidad de Tartu en Estonia, ha publicado un artículo de News & Views en la misma edición de la revista que describe el trabajo realizado por el equipo en este nuevo esfuerzo.
Investigaciones anteriores han demostrado que las variantes genéticas pueden aumentar el riesgo de que una persona desarrolle ciertas enfermedades. En algunos casos, lo hacen al afectar el ARN; tales variantes pueden resultar en la producción de más o menos de lo normal, o en diferencias en las secuencias transcritas. En el último caso, tales diferencias pueden dar lugar a problemas con la secuenciación de aminoácidos.
También se ha descubierto que las variantes ejercen influencia en las moléculas de ARN a medida que se someten a la edición de ARN A a I, que es un proceso que involucra subunidades de ARN que experimentan cambios de adenosina a inosina. En este nuevo esfuerzo, los investigadores analizaron la posibilidad de una asociación entre este tipo de variantes y trastornos autoinmunes.
El trabajo del equipo consistió en extraer datos del catálogo Genotype-Tissue Expression y filtrarlos para encontrar ejemplos de variantes que impactan en la edición del ARN. Al hacerlo, encontraron datos de tejido de 838 donantes humanos con tales variantes. Al analizar las variantes, encontraron que tenían un impacto en la fuerza de unión entre la adenosina desaminasa y los ARN.
Luego, los investigadores encontraron que las variantes eran comunes en personas que tenían enfermedades autoinmunes, como el lupus. Y finalmente, encontraron que las mismas variantes parecían tener asociaciones más fuertes con tales enfermedades que con variantes involucradas en el empalme de genes. Concluyen sugiriendo que el tipo de variantes genéticas que observaron, que conducen a la reducción de la edición del ARN A a I, parece estar asociado con un mayor riesgo de trastornos autoinmunes.
Uso de MPRA para determinar vínculos entre variantes genéticas y fenotipos humanos
Qin Li et al, la edición de ARN subyace al riesgo genético de enfermedades inflamatorias comunes, Naturaleza (2022). DOI: 10.1038/s41586-022-05052-x
Kaur Alasoo, Variantes genéticas que modifican el riesgo de enfermedades autoinmunes, Naturaleza (2022). DOI: 10.1038/d41586-022-01641-a
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Citación: Variantes genéticas que amortiguan la edición de ARN A-to-I asociada con un mayor riesgo de trastornos autoinmunes (18 de agosto de 2022) recuperado el 18 de agosto de 2022 de https://medicalxpress.com/news/2022-08-genetic-variants-dampen- a-to-i-rna.html
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