Científicos de Barcelona han lanzado hoy GENIGMA, un videojuego que invita a los jugadores a resolver acertijos mientras generan datos científicos del mundo real que pueden detectar alteraciones en las secuencias genómicas y, en última instancia, avanzar en la investigación del cáncer de mama.
El juego, disponible hoy en iOS y Android y disponible en inglés, español, catalán e italiano, es el resultado de un proyecto de ciencia ciudadana de dos años y medio desarrollado por un equipo de investigadores del Centro de Regulación Genómica (CRG), el Centro Nacional de Análisis Genómico (CNAG-CRG) y profesionales del juego.
El juego fue creado para impulsar los esfuerzos de investigación en todo el mundo que dependen de las líneas de células cancerosas, un recurso crítico utilizado por los científicos para estudiar el cáncer y probar nuevos medicamentos para tratar la enfermedad. Una de las limitaciones de las líneas de células cancerosas es la falta de mapas de referencia del genoma de alta resolución, que son necesarios para ayudar a los investigadores a interpretar sus resultados científicos, por ejemplo, para identificar la ubicación de genes de interés terapéutico o posibles sitios de mutación.
“Las líneas celulares son responsables del descubrimiento de vacunas, quimioterapias para el cáncer o FIV para la infertilidad. Esto las convierte en un pilar de la biología moderna”, explica el profesor de investigación ICREA Marc A. Marti-Renom, con doble afiliación en el CRG y el CNAG-CRG. y cuya investigación sustenta GENIGMA. «Sin embargo, la falta de mapas de referencia del genoma limita el progreso científico actual. Es como pedirle a la gente que navegue por las ciudades modernas usando mapas del pasado. Con la ayuda de otras personas, podemos actualizar estos mapas, lo que nos permitirá avanzar rápidamente en investigación del cáncer de mama».
El grupo de investigación del profesor Marti-Renom ha desarrollado métodos para crear mapas de referencia genómicos mediante la visualización del genoma en un espacio tridimensional. Sin embargo, esto requiere mucho tiempo y recursos para entrenar la inteligencia artificial, así como una gran potencia computacional.
Los investigadores lanzaron GENIGMA porque creen que los datos generados por los jugadores podrían ser un método más eficaz para actualizar los mapas de referencia en comparación con el uso exclusivo de la IA. La ‘inteligencia de rebaño’ de los jugadores también puede proporcionar soluciones creativas en formas en que la IA podría no ser capaz de hacerlo.
Para jugar a GENIGMA, los jugadores deben resolver un rompecabezas que involucra una serie de bloques de diferentes colores y formas. Cada cadena representa una secuencia genética en la línea de células cancerosas, y la forma en que los jugadores organizan los bloques es una solución potencial para la ubicación de los genes.
Los jugadores tienen que reorganizar los bloques para que alcancen la puntuación más alta posible. Cuanto mayor sea el número de jugadores y las puntuaciones más altas, mayor será la probabilidad de que los investigadores hayan encontrado la secuencia correcta para esta ubicación en particular en el mapa de referencia.
“Cualquier persona con un teléfono inteligente desde cualquier parte del mundo puede descargar GENIGMA de forma gratuita y hacer una contribución directa a la investigación, poniendo su lógica y destreza al servicio de la ciencia”, dice Elisabetta Broglio, facilitadora de ciencia ciudadana del CRG. “GENIGMA analizará las soluciones aportadas por los jugadores como colectivo y no como individuos, y aprovechará soluciones creativas imposibles de encontrar con algoritmos deterministas”.
El primer mapa de referencia del genoma que los investigadores intentarán resolver es el de la línea celular de cáncer de mama T-47D, uno de los recursos más utilizados en la investigación del cáncer. El equipo de investigación de GENIGMA estima que 30 mil jugadores resolviendo un promedio de 50 juegos cada uno generaría datos suficientes para revelar el mapa de referencia de los 20.000 genes en esta línea celular de cáncer de mama.
El juego se lanza hoy con una campaña de tres meses: el #GenigmaChallenge. El lunes de cada semana, durante un período total de tres meses, el equipo de GENIGMA introducirá nuevos fragmentos del genoma de la línea celular T-47D para que los jugadores los organicen. Los primeros fragmentos del genoma que deben organizarse son los del cromosoma 17, que contienen una gran cantidad de genes relacionados con el cáncer de mama. Esto incluye BRCA1, cuyas mutaciones se han asociado con aproximadamente el 40 % del cáncer de mama hereditario.
GENIGMA se desarrolló durante dos años y medio, involucrando a más de 500 personas en 13 talleres. El juego fue concebido y probado por un grupo diverso de personas de diferentes orígenes, incluidos investigadores, estudiantes, profesores, artistas, profesionales médicos, especialistas en bioética, periodistas, representantes de organizaciones de pacientes, artistas y desarrolladores de juegos.
De acuerdo a Oriol RipollCreativo en JOCS al SEGON y Coordinador del equipo de diseño de juegos de GENIGMA, «La ciencia a menudo puede parecer inaccesible para la mayoría de las personas, por lo que es tan emocionante poder tomar su teléfono para jugar GENIGMA. No solo puede combinar el atractivo universal y popularidad de los videojuegos para contribuir al avance de la investigación médica, también aprenderá más sobre ciencia».
