Nueva herramienta predice mejor el riesgo de EPOC para personas de ascendencia no europea

Los investigadores de UVA Health y sus colaboradores han desarrollado una mejor manera de predecir el riesgo de enfermedad pulmonar obstructiva crónica (EPOC), una forma progresiva y potencialmente mortal de inflamación pulmonar, para personas de ascendencia no europea.

Las pruebas iniciales de la nueva herramienta más inclusiva revelaron que es mejor para predecir el riesgo de EPOC tanto para los afroamericanos como para los fumadores empedernidos que los modelos existentes que se basaban en información genética recopilada en gran medida de personas de ascendencia europea. Los desarrolladores de la herramienta dicen que su enfoque permitirá a los médicos predecir mejor el riesgo de EPOC para personas de diversa ascendencia en los Estados Unidos y en todo el mundo.

«Nuestro estudio demuestra la posibilidad de aprender de estudios genéticos a gran escala realizados principalmente en grupos de ancestros europeos y luego desarrollar modelos de predicción que puedan usarse para predecir el riesgo genético en otros grupos de ancestros», dijo el investigador Ani W. Manichaikul, Ph. D., de la Facultad de Medicina de la Universidad de Virginia. «Si bien el estudio actual se centra en la predicción del riesgo de EPOC, ya estamos buscando aplicar enfoques similares para mejorar la predicción del riesgo genético de otras enfermedades».

Acerca de la EPOC

Si bien es tratable, la EPOC es una de las principales causas de muerte en los Estados Unidos y en todo el mundo. Aproximadamente 16 millones de estadounidenses tienen EPOC, que es un grupo de afecciones pulmonares que incluye enfisema y bronquitis crónica. El daño pulmonar causado por la EPOC es irreversible y se acumula con el tiempo. Eso hace que la detección y el tratamiento tempranos sean especialmente importantes.

En los últimos años, los médicos han podido predecir el riesgo genético de los pacientes de desarrollar EPOC y otras enfermedades comunes utilizando lo que se denomina «puntuaciones de riesgo poligénico» o PRS. Estos analizan la cantidad total de variaciones genéticas que ocurren naturalmente en una persona y que la predisponen a una enfermedad, en este caso, la EPOC. Hasta la fecha, la mayoría de los estudios genéticos a gran escala disponibles para el estudio del riesgo de enfermedad tienen una representación limitada de ciertos grupos de ancestros, incluidos los afroamericanos y los hispanos, lo que genera una predicción más pobre del riesgo de enfermedad para estos grupos.

Manichaikul y sus colaboradores buscaron mejorar la capacidad de predecir la EPOC al reflejar mejor la diversidad genética del mundo. Para hacerlo, combinaron medidas genéticas con otras medidas moleculares de un grupo de ascendencia diversa que incluía una combinación de ascendencia europea, afroamericanos e hispanos de los Estados Unidos. Sobre la base de estos recursos, desarrollaron lo que denominan «puntuación de riesgo de transcriptoma poligénico derivado de PrediXcan» o PTRS. Este nuevo enfoque incorpora mucha más información sobre los efectos acumulativos de las variaciones genéticas en diferentes grupos de personas. El resultado es un modelo que «tiene una conexión más directa con la biología de la enfermedad subyacente que los enfoques PRS estándar», informan los investigadores en un nuevo artículo científico.

Los científicos pusieron a prueba su nueva herramienta al analizar su capacidad para predecir la EPOC en decenas de miles de participantes en estudios realizados por el programa Trans-Omics for Precision Medicine (TOPMed) patrocinado por el National Heart, Lung and Blood de los Institutos Nacionales de la Salud. Instituto (NHLBI).

Descubrieron que PTRS era mejor para predecir la EPOC en los afroamericanos y mejor para predecir la EPOC de moderada a grave en los fumadores empedernidos. Tal vez como era de esperar (considerando que fue desarrollado para reflejar mejor las poblaciones no europeas), PTRS fue menos efectivo que PRS para predecir la EPOC en personas de ascendencia europea. Pero la disponibilidad de múltiples «bolas de cristal» para predecir la EPOC en diferentes poblaciones nos acerca un paso importante a la verdadera medicina de precisión: una medicina adaptada a cada individuo.

«Hasta ahora, hemos demostrado que al basarnos en datos genómicos combinados con datos de expresión génica de individuos de diversa ascendencia, podemos mejorar la predicción del riesgo genético para algunas personas», dijo Manichaikul, del Centro de Genómica de Salud Pública y Departamento de Salud Pública de la UVA. Ciencias. «Mirando hacia el futuro, estamos emocionados de pensar en cómo podemos construir sobre otras colecciones de datos moleculares de individuos de diversa ascendencia y seguir trabajando en enfoques mejorados para la predicción del riesgo genético de otras enfermedades».

Los investigadores han descrito su herramienta en El Diario Americano de Genética Humana. El equipo de investigación incluyó a Xiaowei Hu, Stephen S. Rich y Manichaikul de UVA. Hu, Rich y Manichaikul no declararon ningún conflicto de interés relacionado con el trabajo. En el documento se incluye una lista completa de divulgaciones.