Los métodos genómicos ayudan al estudio del brote de Shigella en Seattle 2017-2022

Un estudio genómico de un brote sostenido de shigellosis multirresistente en Seattle permitió a los científicos rastrear su origen y propagación. El análisis adicional del patógeno intestinal y sus patrones de transmisión ayudó a dirigir los enfoques de las pruebas, el tratamiento y las respuestas de salud pública.

La reconstrucción genómica del brote de 2017-2022 y una revisión de la atención al paciente y las intervenciones de salud pública utilizadas se informan el 30 de enero en Las enfermedades infecciosas de Lancet.

«El objetivo del estudio», anotaron los investigadores de Seattle, «era comprender mejor la transmisión comunitaria de Shigela y la propagación de la resistencia a los antimicrobianos en nuestra población, y para tratar estas infecciones resistentes a múltiples fármacos de manera más eficaz».

Shigela los brotes son más frecuentes en países sin suficientes recursos de salud pública y saneamiento. Pero los investigadores llamaron Shigela un patógeno oportunista que también puede surgir en regiones de países de altos ingresos cuando las condiciones lo permiten.

Explicaron que sostenida Shigela Los brotes en áreas urbanas plantean un desafío sustancial de salud pública para las poblaciones que intentan hacer frente a las duras condiciones de vida y la falta de instalaciones de higiene.

Los autores principales del artículo son el Dr. Giannoula S. Tansarli, del Departamento de Medicina de Laboratorio y Patología, y el Dr. Dustin R. Long, de la División de Medicina de Cuidados Críticos, Departamento de Anestesiología, ambos de la Facultad de Medicina de la Universidad de Washington. Medicamento.

El autor principal y correspondiente es el Dr. Ferric C. Fang, profesor de medicina y patología de laboratorio y de microbiología en la facultad de medicina de la UW. Supervisa el laboratorio de microbiología clínica en Harborview Medical Center y realiza investigaciones científicas básicas sobre cómo las bacterias causan enfermedades. Fue asistido por su colega de UW Medicine, el Dr. Stephen J. Salipante, patólogo de genética molecular y experto en tecnologías de secuenciación de ADN de próxima generación.

La shigelosis es causada por Shigela bacterias, que pueden producir inflamación en el revestimiento del intestino. Sus síntomas incluyen fiebre, calambres estomacales y diarrea y, en el peor de los casos, disentería y deshidratación. Algunas personas con shigellosis se enferman gravemente y requieren hospitalización. La shigelosis es altamente contagiosa. La transmisión de unas pocas bacterias es suficiente para causar la enfermedad.

De 2017 a 2022, los 178 casos de Shigela identificados por los laboratorios clínicos del Harborview Medical Center y el UW Medical Center se caracterizaron mediante la identificación de especies, pruebas de susceptibilidad y secuenciación del genoma completo. Para el estudio, los investigadores examinaron retrospectivamente la demografía y los resultados clínicos de los pacientes infectados.

De los 178 casos, 78, o el 45,6%, fueron en hombres que tienen sexo con hombres, y 88, o el 51,5%, en personas sin hogar. Aproximadamente la mitad de los Shigela los aislamientos fueron resistentes a múltiples antibióticos.

Los investigadores también tenían datos sobre 143 pacientes que recibieron terapia antimicrobiana. A pesar de la alta presencia de resistencia a los medicamentos Shigelase encontró que casi el 70 por ciento de los pacientes habían recibido una terapia antimicrobiana adecuada para su Shigela infección. Los investigadores agregaron que el diagnóstico rápido y el cultivo de la bacteria para pacientes que buscan atención por diarrea severa, junto con la evaluación de los factores de riesgo y la comprensión local detallada de las poblaciones afectadas, llevaron a altas tasas de tratamiento apropiado. El enfoque de la atención mejoró con el tiempo, a medida que los médicos adquirieron más experiencia con la enfermedad.

La parte del análisis genómico del estudio reveló brotes secuenciales de varios linajes distintos de dos especies de Shigela, S. flexneri y S. sonnei. Se encontró que las diversas poblaciones en riesgo portaban Shigela de diferentes linajes con diferentes rasgos de resistencia a los medicamentos. Esta información ayudó a los médicos a desarrollar pautas de tratamiento efectivas.

¿Cómo fue esto? Shigela brote aparece en Seattle? Los hallazgos genómicos de los investigadores sugieren que provino originalmente de viajeros internacionales de áreas donde Shigela era común Luego se propagó localmente y rápidamente entre los grupos en riesgo.

Los investigadores explicaron que la resistencia a múltiples fármacos Shigela se ha convertido en un creciente problema de salud mundial con muchos brotes en todo el mundo. La mayoría de estos han afectado a hombres que tienen sexo con hombres. Una variedad de patógenos intestinales pueden transmitirse entre hombres de esta manera.

Sin embargo, en los últimos años también se han producido brotes de shigellosis entre personas sin hogar en las ciudades de la costa oeste de los Estados Unidos y Canadá.

La secuenciación del genoma completo permitió a los investigadores determinar que nuevos S. sonnei y S. flexneri Las cepas aparecieron por primera vez en Seattle entre hombres que tienen sexo con hombres. Esto fue seguido rápidamente por la transmisión dentro de la población local de personas sin hogar. Esto se evidenció por el aumento significativo de Shigellosis después de 2020 en el área del condado de Seattle-King entre esta población.

Los brotes eran más intensos en invierno, característica estacional de Shigela lo que podría deberse a un mayor hacinamiento en los refugios y otros lugares durante el clima frío. El Dr. Fang señaló que los casos de shigellosis causados ​​por un S. sonnei cepa ahora se encuentran en Seattle este invierno.

Los brotes de Seattle siguieron patrones característicos de los informados anteriormente en otros países.

Se instituyeron varias medidas de salud pública para limitar la propagación de Shigela. El primero fue buscar posibles fuentes de contratación. Shigela. Se colocaron letreros para disuadir a la gente de beber agua de fuentes decorativas en el centro de Seattle. Los proveedores locales de servicios para personas sin hogar recibieron orientación y recursos de prevención. Los equipos de extensión visitaron campamentos y refugios para pasar la noche para ofrecer educación sobre la salud y mejorar la disponibilidad de agua limpia, baños, estaciones de lavado de manos y otras medidas de saneamiento.

Muchas instalaciones públicas, como baños, lavabos y bebederos, se cerraron como parte de la respuesta a la pandemia de COVID-19. Los funcionarios de salud pública solicitaron la reapertura anticipada de estas instalaciones cerca de campamentos y distritos donde la gente vivía en las calles. También aumentaron la limpieza ambiental de los callejones en el centro de Seattle que se habían utilizado en lugar de los baños.

Los autores señalaron que el estudio de la Shigela El brote en Seattle representó los esfuerzos de colaboración de los centros de salud locales, los laboratorios clínicos y académicos, la administración de antimicrobianos, el control de infecciones y los equipos de salud pública.