Esquema para identificar un subconjunto de sitios de unión con huellas TF. (A) Cuando los TF o los nucleosomas se unen a los TFBS, protegen diferentes longitudes de ADN de las nucleasas en las células moribundas del cuerpo humano. (B) Cuando los fragmentos de cfDNA secuenciados se asignan a TFBS de ± 50 pb, se encuentran cantidades variables de fragmentos de cfDNA cortos y largos en los tres TFBS que se muestran en (A). (C) La distribución de la longitud del fragmento de cfDNA se estima en cada TFBS (barras moradas) y se suaviza mediante la estimación de la densidad del kernel (kde) (línea verde). (D) La agrupación de medios K se realiza en una distribución de longitud suavizada para agrupar TFBS con una distribución de longitud de fragmento de cfDNA similar. Aquí, se muestran distribuciones de longitud suavizadas de grupos de CTCF TFBS. La longitud ponderada (WL) para cada grupo de longitud CTCF se muestra entre paréntesis. AU, unidades arbitrarias. Crédito: Avances de la ciencia DOI: 10.1126/sciadv.abm4358
Investigadores del campus médico Anschutz de la Universidad de Colorado han descubierto cómo extraer información crítica sobre los tumores de cáncer de mama y la progresión de la enfermedad mediante el análisis del plasma sanguíneo en lugar de utilizar biopsias de tejido más invasivas.
«Esto es simplemente una extracción de sangre», dijo el coautor principal del estudio, Peter Kabos, MD, profesor asociado de medicina en la división de oncología médica de la Facultad de Medicina de la Universidad de Colorado y miembro del Centro de Cáncer de la UC. «Esto nos permite mirar debajo de la superficie para ver las características definitorias de la enfermedad. La ventaja es que no necesitamos hacer biopsias de tejido repetidas».
El estudio fue publicado hoy en la revista Avances de la ciencia.
Los investigadores y los médicos analizan el plasma para definir las mutaciones genéticas en el cáncer. El ADN que se encuentra en el plasma contiene mucha más información.
«Solo necesitamos saber dónde buscar», dijo Kabos.
El estudio encontró que el ADN libre de células plasmáticas (cfDNA) contiene receptores de estrógeno (RE) de unión a todo el genoma de alta resolución y perfiles FOXA1 para el cáncer de mama. FOXA1 es un gen asociado con el cáncer de mama.
«Podemos obtener la misma información molecular que obtenemos de las biopsias de tejido directamente de la sangre», dijo el otro coautor principal del estudio, Srinivas Ramachandran, Ph.D., profesor asistente de bioquímica y genética molecular en la Facultad de Medicina de CU. «Si podemos extraer este tipo de información sin hacer una biopsia, podríamos proporcionar más información para las decisiones de tratamiento».
Las células moribundas en el cuerpo humano liberan su contenido en el torrente sanguíneo, dijeron los investigadores. Cuando el cáncer está presente, también libera fragmentos de cfDNA en el plasma.
«Esto sugiere que cfDNA tiene el potencial de mapear el epigenoma del tumor en tiempo real y, por lo tanto, puede ayudar a descubrir el panorama regulatorio del cáncer a partir del plasma», dijo Ramachandran.
Según el estudio, estos hallazgos podrían conducir a un mapa de todo el genoma para definir el estado de la enfermedad, predecir el resultado del tratamiento y quizás elegir la terapia contra el cáncer más eficaz. Nada de eso es práctico ahora debido a los riesgos involucrados en la obtención de tejido tumoral.
«En nuestro estudio, aprovechamos un medio alternativo para obtener la misma información… de una manera mínimamente invasiva para definir la biología de la enfermedad subyacente», escribieron Kabos y Ramachandran.
Ambos dijeron que la información obtenida del ADN del cáncer podría usarse para desarrollar nuevas terapias en el futuro. Y el mismo análisis de plasma utilizado en el cáncer de mama, dijeron, probablemente funcionaría con otras neoplasias malignas.
«Dado que la mayoría de los tumores liberan cfDNA, creemos que nuestra caracterización de los tumores de mama ER+ utilizando huellas de factores de transcripción de cfDNA representa la punta del iceberg para caracterizar los fenotipos tumorales a partir del plasma y es aplicable en todos los estados de enfermedad», dijo Ramachandran, miembro del Centro de Cáncer de CU.
La metilación del ADN libre de células se usa para predecir el beneficio de la quimioterapia en el cáncer de vejiga
Satyanarayan Rao et al, Factor de transcripción: la dinámica del nucleosoma del plasma cfDNA identifica estados impulsados por ER en el cáncer de mama, Avances de la ciencia (2022). DOI: 10.1126/sciadv.abm4358
Citación: Los investigadores encuentran una forma menos riesgosa de monitorear la progresión del cáncer de mama (25 de agosto de 2022) recuperado el 25 de agosto de 2022 de https://medicalxpress.com/news/2022-08-risky-breast-cancer.html
Este documento está sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.
