Perfilado de todo el genoma de 5hmC de cfDNA derivado de pacientes con EA y AA con MM y sus precursores. Se perfiló 5hmC de todo el genoma en muestras de cfDNA de plasma derivadas de pacientes utilizando el 5hmC-Seal y la secuenciación de próxima generación. Los datos de 5hmC-Seal resumidos para cuerpos genéticos fueron los objetivos principales para el análisis diferencial entre MM y sus precursores (MGUS + SMM, es decir, MGUS y SMM combinados) en todas las muestras, usando modelos de regresión logística multivariable, controlando por edad, sexo y raza/población autoinformada. Además, realizamos análisis diferenciales entre pacientes EA y AA con MM solamente. A Las lecturas de 5hmC-Seal capturadas en cfDNA son más abundantes en los cuerpos genéticos en relación con las regiones flanqueantes y se agotan en las regiones promotoras, según las anotaciones de GENCODE (hg19). TSS: sitio de inicio de la transcripción; TES: sitio final de la transcripción. B Las lecturas de 5hmC-Seal capturadas están enriquecidas en modificaciones de histonas que marcan potenciadores (H3K4me1 y H3K27ac) derivados de células B y células T en comparación con otros tipos de tejido. Las anotaciones para H3K4me1 y H3K27ac se obtuvieron del Roadmap Epigenomics Project. El error estándar se muestra como la barra de error. C El mapa de calor muestra los 63 principales cuerpos genéticos diferenciales entre MM y sus precursores en pacientes con EA y AA combinados. D Se muestran las vías KEGG enriquecidas entre los 500 principales cuerpos genéticos diferenciales entre MM y sus precursores en las muestras combinadas de EA y AA. El eje X representa la relación entre el número de genes diferenciales y el total de genes en una vía determinada. E El análisis de enriquecimiento de la red de coexpresión se realizó para cuerpos genéticos diferenciales entre EA y AA para proporcionar más conocimientos biológicos. Específicamente, se muestran tres módulos (Módulo 1: 254 genes; Módulo 2: 156 genes; y Módulo 3: 75 genes) del análisis modular de coexpresión de genes utilizando los 500 principales cuerpos genéticos diferenciales entre pacientes con MM AA y EA como el aporte. NES: puntuación de enriquecimiento normalizado. F–H Se muestran las redes de interacción proteína-proteína construidas para los módulos de coexpresión y/o interacción identificados a partir de cuerpos genéticos diferenciales entre pacientes EA y AA con MM. Crédito: Revista de hematología y oncología (2022). DOI: 10.1186/s13045-022-01327-y
Los investigadores han identificado distintas vías epigenéticas en pacientes afroamericanos y euroamericanos diagnosticados con mieloma múltiple, según un estudio de Northwestern Medicine publicado en la revista Revista de hematología y oncología.
Los hallazgos mejoran la comprensión de los mecanismos epigenéticos que subyacen a las disparidades en el diagnóstico de enfermedades y revelan posibles objetivos terapéuticos.
«Podríamos utilizar estas modificaciones epigenéticas específicas de la población para diagnosticar mejor en esos pacientes o prevenir el mieloma múltiple de una manera específica de la población», dijo Wei Zhang, Ph.D., profesor de medicina preventiva en la División de Epidemiología y Prevención del Cáncer y autor principal del estudio.
El mieloma múltiple (MM) ocurre cuando los glóbulos blancos cancerosos, específicamente las células plasmáticas, se acumulan en la médula ósea. Las células plasmáticas son clave para una respuesta inmunitaria adecuada, pero en el MM, las células plasmáticas cancerosas superan a las células formadoras de sangre normales, lo que provoca recuentos sanguíneos bajos.
El diagnóstico de MM es raro, sin embargo, trabajos previos han encontrado que la enfermedad tiene de dos a tres veces más probabilidades de ser diagnosticada en afroamericanos que en europeos americanos. Si bien los factores de riesgo, como los factores socioeconómicos y la obesidad, pueden contribuir a las diferentes tasas de diagnósticos en esta población de pacientes, no explican por completo el aumento del riesgo, según Zhang.
«El mieloma múltiple es muy diferente, porque hasta ahora, desde el punto de vista clínico o epidemiológico y según los factores de riesgo conocidos, realmente no tenemos la capacidad de distinguir a los pacientes con un riesgo más alto o más bajo en nuestra población general», dijo Zhang.
El equipo tuvo como objetivo identificar modificaciones en 5-hidroximetilcitosinas (5hmC), un biomarcador epigenético conocido de cánceres que aún no se había investigado en el contexto de MM.
En el estudio, los investigadores utilizaron 5hmC-Seal, una técnica basada en el etiquetado químico que captura las modificaciones epigenéticas en fragmentos de ADN y la secuenciación del genoma de próxima generación para perfilar muestras de ADN de 342 pacientes con MM y condiciones de alto riesgo: 227 europeos estadounidenses y 115 pacientes afroamericanos.
De los 500 genes de mayor rango identificados con diferentes niveles de 5hmC, los investigadores encontraron que el 95 por ciento contenía vías celulares específicas de la población. Específicamente, las vías del metabolismo de los aminoácidos fueron más frecuentes en los pacientes afroamericanos y las vías de señalización relacionadas con el cáncer fueron más frecuentes en los pacientes europeos americanos.
«Identificamos vías relacionadas con 5hmC específicas de la población entre los pacientes con mieloma múltiple y aquellos con condiciones de alto riesgo, lo que significa que parece haber alguna vía biológica específica de la población que conduce a esta enfermedad en estos pacientes», dijo Zhang.
Según Zhang, los próximos pasos incluyen determinar si estas modificaciones epigenéticas específicas de la población contribuyen a las diferentes tasas de supervivencia de los pacientes.
«Si observamos que el 5hmC específico de la población está relacionado con la supervivencia diferencial del paciente, entonces podríamos utilizar el 5hmC como un biomarcador novedoso que puede ayudarnos a monitorear la respuesta al tratamiento y detectar pacientes con enfermedad residual mínima de una manera específica de la población», dijo Zhang. .
Un tratamiento único para el cáncer de la sangre probablemente no sirve para todos, dicen los investigadores
Brian C.-H. Chiu et al, El perfil de todo el genoma de 5-hidroximetilcitosinas en el ADN circulante libre de células revela vías específicas de la población en el desarrollo del mieloma múltiple, Revista de hematología y oncología (2022). DOI: 10.1186/s13045-022-01327-y
Citación: Investigación de las diferencias raciales en el mieloma múltiple (7 de septiembre de 2022) recuperado el 7 de septiembre de 2022 de https://medicalxpress.com/news/2022-09-racial-differences-multiple-myeloma.html
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