¿Saber de dónde vinieron sus antepasados podría ser la clave para mejores tratamientos contra el cáncer? Tal vez, pero ¿dónde encajaría esa llave? ¿Cómo podemos rastrear las raíces ancestrales del cáncer hasta las soluciones modernas? Para el profesor de investigación del Laboratorio Cold Spring Harbor (CSHL), Alexander Krasnitz, las respuestas pueden encontrarse en lo profundo de vastas bases de datos y archivos hospitalarios que contienen cientos de miles de muestras de tumores.
Krasnitz y el becario posdoctoral de CSHL, Pascal Belleau, están trabajando para revelar las conexiones genealógicas entre el cáncer y la raza o el origen étnico. Han desarrollado un nuevo software que infiere con precisión la ascendencia continental a partir del ADN y el ARN tumorales. Su trabajo también puede ayudar a los médicos a desarrollar nuevas estrategias para la detección temprana del cáncer y tratamientos personalizados.
«¿Por qué las personas de diferentes razas y etnias se enferman en diferentes tasas con diferentes tipos de cáncer?» dice Krasniz. «Tienen diferentes hábitos, condiciones de vida, exposiciones, todo tipo de factores sociales y ambientales. Pero también puede haber un componente genético».
El equipo de Krasnitz entrenó sus herramientas de software utilizando perfiles de ADN híbrido. Crearon estos perfiles a partir de genomas cancerosos y libres de cáncer no relacionados de antecedentes conocidos. Luego probaron el rendimiento del software contra muestras de cáncer de páncreas, ovario, mama y sangre de pacientes con ascendencia conocida. El equipo descubrió que el software hacía coincidir sus perfiles híbridos con las poblaciones continentales con más del 95 % de precisión.
«Tenemos un buen modelo sobre el que construir», dice Krasnitz. «Pero muy pocos individuos provienen de una sola ascendencia. Todos somos mixtos hasta cierto punto. Así que ahora estamos trabajando para profundizar, analizar muestras de tumores de ascendencia desconocida, revelar mezclas ancestrales y lograr una mayor especificidad regional». ¿Qué tan específico? Por ahora, piense en África occidental en lugar de África oriental.
Krasnitz y Belleau se unieron recientemente a un estudio de cáncer colorrectal en colaboración con Northwell Health y SUNY Downstate Medical Center. El estudio les permite explorar cómo el cáncer colorrectal muta los genes de diferentes maneras según las razas o etnias específicas. Esperan refinar aún más su software para inferir la ascendencia no solo de genomas completos sino de cada secuencia individual en ellos.
«Si podemos identificar ancestros más localizados que son susceptibles a diferentes tipos de cáncer u otras enfermedades agresivas, podría ayudarnos a identificar la parte específica del genoma responsable y tratarla», dice Belleau.
En este momento, un simple hisopo de ADN puede decirle de dónde viene y qué enfermedades puede heredar. En el futuro, podría darte los medios para vencerlos también.
Fuente de la historia:
Materiales proporcionado por Laboratorio de puerto de Cold Spring. Original escrito por Nick Wurm. Nota: el contenido se puede editar por estilo y longitud.
