Nueva tecnología identifica ‘espías’ de células tumorales raras

Investigadores de la Universidad de Ciencia y Tecnología de Hong Kong (HKUST, por sus siglas en inglés) desarrollaron una tecnología novedosa que permite que la secuenciación del ARN y el ADN genómico se lleve a cabo simultáneamente en células individuales de tejidos congelados y frescos, e identificaron «espías» de células tumorales cerebrales raras disfrazadas de células normales con este método. Este avance facilita la investigación del cáncer para algunos de los tumores más complejos y raros, abriendo nuevas direcciones para el descubrimiento de objetivos farmacológicos en el futuro.

La secuenciación del ADN y ARN genómico es crucial para determinar el tratamiento del cáncer, ya que ofrece información importante sobre la composición genómica y molecular del tumor, o la heterogeneidad celular, que influye en la patología de la enfermedad, así como en la capacidad del tumor para desarrollar resistencia a los medicamentos.

Nuestro conocimiento actual sobre los cánceres no explica completamente por qué los tumores recaen o se vuelven resistentes al tratamiento; Explorar nuevas dimensiones de la composición del tumor a alta resolución al observar el ADN y el ARN juntos puede proporcionar respuestas. Sin embargo, las tecnologías existentes tienen una aplicabilidad limitada para realizar simultáneamente la secuenciación de ADN y ARN en células individuales de tejidos congelados de biobancos; sin embargo, estos tejidos congelados constituyen la mayoría de las muestras clínicas de cáncer fácilmente disponibles.

Ahora, un equipo dirigido por la profesora Angela Wu, profesora asociada de la División de Ciencias de la Vida y el Departamento de Ingeniería Química y Biológica de HKUST y su becaria postdoctoral, la Dra. Lei YU, desarrollaron una nueva tecnología versátil de perfilado multiómico unicelular scONE -seq, que puede analizar células congeladas y tipos de células difíciles de obtener, como huesos y cerebro. Este nuevo método también puede recopilar simultáneamente información genómica y transcriptómica en un tumor a través de una reacción de un solo recipiente.

El astrocitoma es un tipo de tumor cerebral mortal y agresivo, y los pacientes con este tipo de tumor tienen una tasa de supervivencia de solo alrededor del 5 por ciento dentro de los cinco años posteriores al diagnóstico de la enfermedad. Usando su nueva tecnología de células individuales, el equipo descubrió una subpoblación de células tumorales pequeña y única en la muestra de astrocitoma de un paciente.

Esta población tumoral única se disfrazó de astrocitos normales del cerebro, que podrían escapar a la detección utilizando otros métodos comunes de secuenciación de tumores. Además, esta célula tumoral ‘espía’ también mostró características moleculares que están relacionadas con la resistencia a los medicamentos; el papel integral de esta célula tumoral ‘espía’ en la progresión del tumor será una dirección importante para futuras investigaciones de esta enfermedad y posibles dianas farmacológicas.

Wu dijo: «Al identificar células tumorales raras que los enfoques anteriores podrían pasar por alto y dar como resultado una falla en la respuesta a la terapia, el enfoque scONE-seq representa un nuevo camino para descubrir objetivos farmacológicos y el desarrollo de nuevos medicamentos. Planeamos continuar nuestro trabajo, usando scONE-seq para perfilar una cohorte de pacientes más grande, y espero tener más resultados clínicamente traslacionales en el futuro».

El estudio se publica en la revista Zenodo.