A pesar de la falta de Khairy de una posición de liderazgo en el partido UMNO, Muhyiddin nombró a Khairy como ministro de ciencia e innovación.
COVID-19 IMPULSÓ A KHAIRY AL CENTRO DE ATENCIÓN
Más tarde, cuando la COVID-19 se apoderó gradualmente de Malasia, Muhyiddin puso a Khairy a cargo del programa nacional de vacunación. Eso impulsó a Khairy una vez más al centro de atención, mientras los malasios se apresuraban a vacunarse a sí mismos y a sus seres queridos contra el virus mortal.
El manejo firme y capaz de Khairy del programa de vacunación, con participación personal frecuente en el terreno y decisiones respaldadas por la ciencia, le valió el aplauso del público en general. Se volvió tan indispensable en el esfuerzo de lucha contra la pandemia que cuando Ismail Sabri Yaakob de UMNO asumió el cargo de primer ministro, Khairy fue nombrado ministro de salud.
Pero ese tipo de aclamación pública aumentada aparentemente no hizo que Khairy fuera particularmente popular entre los líderes de base o de alto nivel dentro de UMNO, que veían a Khairy como una gran amenaza para sus propios avances políticos.
En GE15, la facción mayoritaria de la UMNO sacó a Khairy de su circunscripción parlamentaria casi segura de Rembau a favor del número dos del partido, Mat Hassan. En cambio, Khairy tuvo que conformarse con el bastión de PH, Sungai Buloh. Hizo una vigorosa campaña electoral, pero finalmente no fue suficiente para arrebatarle el escaño seguro de PH.
En los dos meses transcurridos desde entonces, Khairy, visiblemente descontento, ya no se anduvo con rodeos. Declaró abiertamente su ambición política de eventualmente convertirse en primer ministro de Malasia. Criticó rotundamente a la alta dirección del partido por no celebrar elecciones para los dos puestos principales del partido.
Zahid escuchó y finalmente se cansó de las quejas de Khairy, al expulsarlo de UMNO el 28 de enero.