El desarrollo del campo de la metagenómica, el estudio del material genético de muestras ambientales, ha revolucionado la forma en que observamos y descubrimos nuevas especies. Muchas bacterias no se pueden cultivar de forma independiente en el laboratorio. A veces esto se debe a que el medio en el que se cultivan no es adecuado, a veces se debe a que estas bacterias prosperan solo en comunidades de múltiples especies (¡como muchas bacterias en nuestro intestino!) y a veces se debe a que solo pueden crecer en relación con otro organismo más grande. . Un grupo de bacterias pertenecientes a la categoría final son Candidatus phylum Dependentiae. No se sabe mucho sobre este grupo porque hasta el momento solo se han aislado tres cepas pertenecientes a él. Pero en un estudio reciente, publicado en Anuncios de recursos de microbiologíael profesor Masaharu Takemura de la Universidad de Ciencias de Tokio (TUS) logró aislar la cuarta cepa de este tipo: Noda2021.
“Inicialmente, tomamos muestras del Parque Risoukai en el Campus Noda de TUS con el objetivo de aislar un virus gigante al examinarlo utilizando un huésped de laboratorio común ‘Vermamoeba vermiformis’. Sin embargo, en el proceso de hacerlo, descubrimos accidentalmente esta rara bacteria que también infecta a Vermamoeba», dice el Dr. Takemura.
Para aislar la nueva cepa, el Dr. Takemura primero cultivó una muestra obtenida del estanque en el Parque Risoukai y luego la agregó a un cultivo de Vermamoeba. Después de cultivar la Vermamoeba durante unos días, extrajo Noda2021 de esta y luego realizó un análisis de su material genético.
«Descubrimos que la cepa Noda2021 consta de 1 222 284 pares de bases con aproximadamente un 38,3 % de contenido de guanina y citosina (GC) y 1287 genes. Luego realizamos un análisis filogenético molecular de ARNr 16S de la cepa y descubrimos que está relativamente cerca de uno de los otras cepas de Candidatus phylum Dependentiae aisladas hasta ahora, ‘Vermiphilus pyriformis'», explica el Dr. Takemura. También examinó las células Vermamoeba infectadas bajo un microscopio electrónico y descubrió que Noda2021 a veces exhibía una estructura celular conectada dentro de sus células anfitrionas.
«Este descubrimiento es evidencia de que el estanque en el campus de Noda es microbiológicamente diverso y ecológicamente emocionante», dice el Dr. Takemura. Esta es también la primera vez que se aísla una cepa de este tipo en Japón.
El aislamiento de esta nueva cepa de Candidatus phylum Dependentiae seguramente mejorará nuestra comprensión de este curioso grupo bacteriano. Según el Dr. Takemura, «Esta bacteria se encuentra en la región fronteriza entre los virus gigantes y las microbacterias, por lo que esperamos que proporcione información útil y única sobre el origen y la posición ecológica de estos dos grupos».
Fuente de la historia:
Materiales proporcionado por Universidad de Ciencias de Tokio. Nota: el contenido se puede editar por estilo y longitud.
