Verstappen marcó el ritmo de referencia con gomas medias en las primeras etapas antes de mejorar con su cambio a blandas, superando a Leclerc por 0,347 segundos en una sesión complicada para los Ferrari.
En Williams, la apendicitis obligó a Albon a quedarse al margen y al ex campeón de Fórmula E, De Vries, a ocupar su asiento durante el resto del GP de Italia.
De Vries, que condujo para Aston Martin en la FP1 en lugar de Sebastian Vettel, llegó al circuito de Monza antes de su debut en la carrera el domingo con 36 minutos restantes de la sesión de una hora e inmediatamente fue 18° con neumáticos medianos.
Un comienzo lento de la práctica final del fin de semana de Monza significó que solo seis pilotos registraron tiempos de vuelta después de los primeros 10 minutos de carrera.
Sergio Pérez de Red Bull estableció el punto de referencia inicial con un 1m23.448s en caucho medio.
Posteriormente mejoró a 1m22.611s y 1m22.148s, con Valtteri Bottas de Alfa Romeo alrededor de dos segundos a la deriva en segundo después de una carrera inicial sobre caucho blando.
El compañero de equipo de Red Bull de Pérez, Verstappen, se vio obligado a abortar su primera vuelta rápida con neumáticos medianos poco más de 10 minutos después de la sesión cuando se encontró con un tráfico lento en la forma de George Russell de Mercedes.
Varios pilotos se encontraban con tráfico lento en sus vueltas rápidas, y Bottas casi choca por detrás con el Ferrari de un Carlos Sainz en la curva 1 a los 20 minutos.
Bottas se vio obligado a atravesar la primera chicane después de pincharse los neumáticos blandos para intentar evitar a Pérez, y los comisarios pusieron el incidente bajo investigación antes de elegir convocar al español después de la FP3.
La sesión de Sainz tuvo otra complicación cuando se le dijo que boxeara poco después con un supuesto problema en el sistema de combustible, aunque pudo volver a la pista cuando quedaba alrededor de media hora.
Después de que Russell obstaculizara su vuelta inicial de contrarreloj, Verstappen disparó a la cima de la clasificación con un tiempo de 1:21.872 con neumáticos medianos poco menos de 20 minutos después de iniciada la sesión mientras los Ferrari de Leclerc subían al segundo lugar con el mismo compuesto.
La posición de Verstappen se mantuvo intacta cuando Sainz subió al segundo lugar con goma blanda con 15 minutos restantes antes de que el piloto de Red Bull produjera un tiempo de 1:21.252 en su simulación de clasificación con el neumático de pared roja.
Esta sería la mejor vuelta del fin de semana hasta ahora de cara a la calificación, con Leclerc en segundo lugar detrás de Pérez.
Leclerc logró su primera vuelta rápida con neumáticos blandos hacia el final de la FP3, sacando lo mejor del compuesto para su segundo intento.
Sainz ha finalizado la sesión cuarto por delante del Alpine de Fernando Alonso y del McLaren Lando Norris.
Russell fue el más rápido de los pilotos de Mercedes en el séptimo puesto por detrás de Yuki Tsunoda en AlphaTauri y Esteban Ocon de Alpine, quien se une a la lista de nueve que enfrentan penalizaciones en la parrilla para la carrera del domingo.
Lewis Hamilton completó el top 10 en la hermana Mercedes por delante de Zhou Guanyu de Alfa Romeo, Pierre Gasly (AlphaTauri) y el dúo Williams de Nicholas Latifi y de Vries.
De Vries mejoró a 1m22.869s, aunque sufrió un momento fuera de la pista al salir del primer Lesmo con alrededor de media hora de la sesión aún por correr.
Daniel Ricciardo de McLaren encabezó a Bottas, Sebastian Vettel de Aston Martin, el dúo de Haas Kevin Magnussen y Mick Schumacher, quien permaneció en su garaje hasta los últimos 10 minutos debido a un problema con el embrague, y Lance Stroll en el segundo Aston.
